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无尘车间装修的建筑布局和净化空调系统有密切关系，净化空调系统既要服从建筑总体布局，建筑布局也要符合净化空调系统的原则，才能充分发挥相关功能的作用。净化空调的设计者不仅要了解建筑布局以考虑系统的布置，而且要给建筑布局提出要求，使其符合无尘车间原理。
无尘车间装修设计的平面布局
无尘车间一般包括洁净区，准洁净区和辅助区三部分，无尘车间的平面布置可以有以下几种方式：
外廊环绕式：外廊可以有窗和无窗，兼作参观和放置一些设备用，有的在外廊内设值班采暖。外窗必须是双层密封窗。
内廊式：无尘车间设在外围，而走廊设在内部，这种走廊的洁净度级别一般都较高，甚至和无尘车间同级。
两端式：洁净区设在一边，另一边设准洁净和辅助用房。
核心式：为了节约用地，缩短管线，可以洁净区为核心，上下左右被各种辅助用房和隐蔽管道的空间包围起来，这种方式避开室外气候对洁净区的影响，减少冷热能耗，利于节能。
人身净化路线
为了在操作中尽量减少人活动产生的污染，人员在进入洁净区之前，必须更换洁净服并吹淋，洗澡，消毒，这些措施即人身净化简称人净，人净用房中更换洁净服的房间应予送风，并对入口侧等其他房间保持正压，对厕所，淋浴保持少许正压，而厕所，淋浴应保持负压。
物料净化路线
各种物件在送入洁净区前必须经过净化处理，简称，物净。
物料净化路线与人净路线应分开，如果物料与人员只能在同一处进入无尘车间，也必须分门而入，物料并先经过粗净化处理。
对于生产流水线不强的场合在物料路线中间可设中间库。
如果生产流水线很强，则采用直通式物料路线，有时还需要在直通路线中间设多次净化，传递设施。在系统设计上，物净用房的粗净化和精净化阶段由于会吹落很多生微粒，所以相对洁净区应保持负压或零压，如果污染危险性大则对入口方向也要保持负压。